Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus1Q9WU56 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms