Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU20

Mthfr, Methylenetetrahydrofolate reductase, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MthfrQ9WU20 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MthfrQ9WU20 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MthfrQ9WU20 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms