Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul1Q9WTX6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cul1Q9WTX6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms