Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skp1Q9WTX5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skp1Q9WTX5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms