Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Ntn3Q9R1A3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Ntn3Q9R1A3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ntn3Q9R1A3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ntn3Q9R1A3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ntn3Q9R1A3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms