Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt71Q9R0H5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt71Q9R0H5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt71Q9R0H5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms