Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas3Q9QZQ0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas3Q9QZQ0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms