Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ercc4Q9QZD4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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