Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cbx8Q9QXV1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cbx8Q9QXV1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms