Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copg2Q9QXK3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Copg2Q9QXK3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms