Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rai2Q9QVY8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rai2Q9QVY8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms