Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdkl2Q9QUK0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdkl2Q9QUK0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms