Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
DUOX2Q9NRD8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
DUOX2Q9NRD8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms