Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH7

Neu3, Sialidase-3, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neu3Q9JMH7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neu3Q9JMH7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neu3Q9JMH7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neu3Q9JMH7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neu3Q9JMH7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neu3Q9JMH7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neu3Q9JMH7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neu3Q9JMH7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neu3Q9JMH7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neu3Q9JMH7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Neu3Q9JMH7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Neu3Q9JMH7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Neu3Q9JMH7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Neu3Q9JMH7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Neu3Q9JMH7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Neu3Q9JMH7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Neu3Q9JMH7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neu3Q9JMH7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neu3Q9JMH7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neu3Q9JMH7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neu3Q9JMH7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neu3Q9JMH7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neu3Q9JMH7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neu3Q9JMH7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neu3Q9JMH7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Neu3Q9JMH7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Neu3Q9JMH7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms