Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Dnaja4Q9JMC3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaja4Q9JMC3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms