Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nectin3Q9JLB9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms