Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CtsmQ9JL96 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtsmQ9JL96 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtsmQ9JL96 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtsmQ9JL96 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtsmQ9JL96 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtsmQ9JL96 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtsmQ9JL96 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtsmQ9JL96 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtsmQ9JL96 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtsmQ9JL96 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtsmQ9JL96 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtsmQ9JL96 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtsmQ9JL96 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtsmQ9JL96 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtsmQ9JL96 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtsmQ9JL96 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtsmQ9JL96 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CtsmQ9JL96 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtsmQ9JL96 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtsmQ9JL96 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtsmQ9JL96 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CtsmQ9JL96 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtsmQ9JL96 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtsmQ9JL96 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtsmQ9JL96 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtsmQ9JL96 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms