Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY5

Hip1r, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1rQ9JKY5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hip1rQ9JKY5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hip1rQ9JKY5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hip1rQ9JKY5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hip1rQ9JKY5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hip1rQ9JKY5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hip1rQ9JKY5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hip1rQ9JKY5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hip1rQ9JKY5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hip1rQ9JKY5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hip1rQ9JKY5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hip1rQ9JKY5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hip1rQ9JKY5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hip1rQ9JKY5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hip1rQ9JKY5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hip1rQ9JKY5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hip1rQ9JKY5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hip1rQ9JKY5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hip1rQ9JKY5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hip1rQ9JKY5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hip1rQ9JKY5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hip1rQ9JKY5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hip1rQ9JKY5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hip1rQ9JKY5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hip1rQ9JKY5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hip1rQ9JKY5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hip1rQ9JKY5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hip1rQ9JKY5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hip1rQ9JKY5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hip1rQ9JKY5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hip1rQ9JKY5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hip1rQ9JKY5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hip1rQ9JKY5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hip1rQ9JKY5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hip1rQ9JKY5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hip1rQ9JKY5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hip1rQ9JKY5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hip1rQ9JKY5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hip1rQ9JKY5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hip1rQ9JKY5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hip1rQ9JKY5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms