Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Chrac1Q9JKP8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Chrac1Q9JKP8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Chrac1Q9JKP8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Chrac1Q9JKP8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Chrac1Q9JKP8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chrac1Q9JKP8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms