Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pole3Q9JKP7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pole3Q9JKP7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pole3Q9JKP7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pole3Q9JKP7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pole3Q9JKP7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pole3Q9JKP7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pole3Q9JKP7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pole3Q9JKP7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms