Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rcan3Q9JKK0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms