Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pard6bQ9JK83 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pard6bQ9JK83 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pard6bQ9JK83 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms