Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Alyref2Q9JJW6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Alyref2Q9JJW6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms