Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp1r3fQ9JIG4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r3fQ9JIG4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms