Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

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Length 953 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Copb1Q9JIF7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Copb1Q9JIF7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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