Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RabggtaQ9JHK4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RabggtaQ9JHK4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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