Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cldn12Q9ET43 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn12Q9ET43 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms