Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Brd4Q9ESU6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Brd4Q9ESU6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Brd4Q9ESU6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms