Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Clstn2Q9ER65 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Clstn2Q9ER65 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Clstn2Q9ER65 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms