Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQC0

Chst1, Carbohydrate sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst1Q9EQC0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chst1Q9EQC0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chst1Q9EQC0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chst1Q9EQC0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chst1Q9EQC0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chst1Q9EQC0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chst1Q9EQC0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chst1Q9EQC0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chst1Q9EQC0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chst1Q9EQC0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Chst1Q9EQC0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Chst1Q9EQC0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chst1Q9EQC0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chst1Q9EQC0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chst1Q9EQC0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chst1Q9EQC0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chst1Q9EQC0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chst1Q9EQC0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chst1Q9EQC0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chst1Q9EQC0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chst1Q9EQC0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chst1Q9EQC0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chst1Q9EQC0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chst1Q9EQC0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chst1Q9EQC0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chst1Q9EQC0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chst1Q9EQC0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chst1Q9EQC0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms