Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ48

V1ra8, Vomeronasal type-1 receptor A8, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra8Q9EQ48 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
V1ra8Q9EQ48 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
V1ra8Q9EQ48 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms