Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPT1

Vmn1r63, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r63Q9EPT1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r63Q9EPT1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms