Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL9

Acox3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acox3Q9EPL9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acox3Q9EPL9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acox3Q9EPL9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms