Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ap3s1Q9DCR2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ap3s1Q9DCR2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ap3s1Q9DCR2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ap3s1Q9DCR2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ap3s1Q9DCR2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ap3s1Q9DCR2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ap3s1Q9DCR2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ap3s1Q9DCR2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap3s1Q9DCR2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap3s1Q9DCR2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap3s1Q9DCR2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap3s1Q9DCR2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap3s1Q9DCR2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap3s1Q9DCR2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap3s1Q9DCR2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap3s1Q9DCR2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap3s1Q9DCR2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap3s1Q9DCR2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap3s1Q9DCR2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap3s1Q9DCR2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap3s1Q9DCR2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap3s1Q9DCR2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap3s1Q9DCR2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap3s1Q9DCR2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms