Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms