Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fundc1Q9DB70 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms