Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrmuQ9DAT5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrmuQ9DAT5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrmuQ9DAT5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrmuQ9DAT5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrmuQ9DAT5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrmuQ9DAT5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrmuQ9DAT5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrmuQ9DAT5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrmuQ9DAT5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrmuQ9DAT5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrmuQ9DAT5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TrmuQ9DAT5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TrmuQ9DAT5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TrmuQ9DAT5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrmuQ9DAT5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrmuQ9DAT5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms