Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms