Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scp2d1Q9DAH1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scp2d1Q9DAH1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scp2d1Q9DAH1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scp2d1Q9DAH1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scp2d1Q9DAH1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scp2d1Q9DAH1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scp2d1Q9DAH1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scp2d1Q9DAH1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scp2d1Q9DAH1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scp2d1Q9DAH1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scp2d1Q9DAH1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scp2d1Q9DAH1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scp2d1Q9DAH1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scp2d1Q9DAH1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scp2d1Q9DAH1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scp2d1Q9DAH1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scp2d1Q9DAH1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.8 ms