Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd8Q9DA37 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms