Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q9D9H8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q9D9H8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Q9D9H8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Q9D9H8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Q9D9H8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Q9D9H8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Q9D9H8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Q9D9H8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Q9D9H8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Q9D9H8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Q9D9H8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Q9D9H8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Q9D9H8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Q9D9H8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Q9D9H8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Q9D9H8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Q9D9H8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Q9D9H8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Q9D9H8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Q9D9H8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Q9D9H8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Q9D9H8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Q9D9H8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Q9D9H8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Q9D9H8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Q9D9H8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Q9D9H8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Q9D9H8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Q9D9H8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Q9D9H8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Q9D9H8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Q9D9H8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Q9D9H8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Q9D9H8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Q9D9H8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Q9D9H8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Q9D9H8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Q9D9H8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Q9D9H8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Q9D9H8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Q9D9H8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Q9D9H8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Q9D9H8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Q9D9H8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Q9D9H8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Q9D9H8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Q9D9H8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Q9D9H8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Q9D9H8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms