Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Speer4bQ9D9F7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Speer4bQ9D9F7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Speer4bQ9D9F7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Speer4bQ9D9F7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Speer4bQ9D9F7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Speer4bQ9D9F7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Speer4bQ9D9F7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Speer4bQ9D9F7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Speer4bQ9D9F7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Speer4bQ9D9F7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Speer4bQ9D9F7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Speer4bQ9D9F7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms