Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X2

Ccdc124, Coiled-coil domain-containing protein 124, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc124Q9D8X2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc124Q9D8X2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc124Q9D8X2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc124Q9D8X2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc124Q9D8X2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc124Q9D8X2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc124Q9D8X2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc124Q9D8X2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc124Q9D8X2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms