Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D8L0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8L0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8L0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D8L0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D8L0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D8L0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8L0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8L0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8L0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms