Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms