Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fip1l1Q9D824 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fip1l1Q9D824 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms