Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp5Q9D7S9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Chmp5Q9D7S9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms