Protein–RNA interactions for Protein: Q9D753

Exosc8, Exosome complex component RRP43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc8Q9D753 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exosc8Q9D753 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Exosc8Q9D753 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Exosc8Q9D753 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Exosc8Q9D753 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Exosc8Q9D753 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Exosc8Q9D753 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Exosc8Q9D753 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Exosc8Q9D753 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Exosc8Q9D753 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Exosc8Q9D753 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Exosc8Q9D753 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Exosc8Q9D753 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc8Q9D753 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc8Q9D753 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc8Q9D753 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc8Q9D753 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc8Q9D753 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc8Q9D753 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc8Q9D753 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc8Q9D753 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc8Q9D753 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc8Q9D753 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc8Q9D753 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc8Q9D753 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc8Q9D753 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc8Q9D753 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc8Q9D753 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc8Q9D753 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc8Q9D753 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Exosc8Q9D753 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Exosc8Q9D753 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms