Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sf3a3Q9D554 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3a3Q9D554 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms