Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc7Q9D541 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ccdc7Q9D541 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms